Осторожно спойлер:
В космическом корабле «Эдем», некоторое продолжительное время странствующем в пространстве, два человека, Бенджамин и Ли, пробуждаются в отсеках, не помня, как они туда попали. Бенджамин, инженер, и Ли, солдат, быстро понимают, что броненосец находится в критическом состоянии. Они пытаются выяснить, что произошло, и, исследуя запущенные коридоры, сталкиваются с жуткими видениями и ненормальными звуками, которые усиливают их тревогу. Очутившись в темноте, они осознают, что не одни и на борту существует нечто опасное.
Постепенно Бенджамин и Ли наталкиваются на группу выживших, которые стараются выжить в условиях, неизвестных им ранее. Они узнают, что люди, сохранившиеся на корабле, подверглись мутациям и стали агрессивными. Выжившие обмениваются своими знаниями о том, что корабль, вероятно, заброшен, и что они - последние фрагменты экипажа. Ситуация становится всё более напряженной, и иногда становится очевидно, что время на исходе, а ресурсы истощаются. Бенджамин начинает осознавать, что его собственные воспоминания могут иметь первостепенное значение в разгадке происходящего, но какова цена правды, и что именно скрывает «Эдем»?
Тревога нарастает, и иногда Бенджамин понимает, что его внутренние страхи и травмы могут быть связаны с тем, что происходит на корабле. Он не может доверять никому из последних выживших, и каждый шаг может стать фатальным. Ли, как солдат, старается взять ситуацию под контроль, но также его психическое состояние начинает давать сбой. Чем больше они углубляются в тайны корабля, тем яснее становится, что «Пандорум» - это не просто болезнь, а нечто более зловещее, способное привести к катастрофе.