Осторожно спойлер:
Во всем мире, охваченном катастрофой, общество сталкивается с угрозой из глубин океана. Громадные монстры, известные как кайдзю, нападают на города и уничтожают все на своем пути. Генеральным героям, пилоту Рейне и его напарнику Мэко, светит стать частью программы по созданию роботов-гигантов, которые могут сразиться с этими чудовищами. Они проходят требовательную подготовку и учатся управлять военными машинами, чтобы бороться на передовой. В это время враг становится все более агрессивным, и время на подготовку истекает.
Рейна и Мэко сталкиваются с различными проблемами во время тренировок и боев. Каждый раз, когда они садятся в свои механизированные машины, требуется не только физическая сила, но и полная самосинхронизация между пилотами. Однако на пути к победе им необходимо преодолевать не только внешние угрозы, но и внутренние инциденты и страхи. В ходе поединков с кайдзю они делают величественные открытия о своих врагах и о том, как можно их одолеть. Но чем больше они узнают, тем яснее становится, что победить кайдзю будет не так просто, как они надеялись.
Ситуация накаляется, и Рейна с Мэко начинают осознавать, что за атаками кайдзю может скрываться нечто большее, чем просто естественное бедствие. Агентурная справка указывает на спонтанные связи между людьми и монстрами. В это время руководство программы после войны с кайдзю принимает решение о новом рубеже операций, однако последствия этого шага могут оказаться разрушительными. Какой ценой они добьются победы?